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Rápidos avanços estavam sendo feitos nas áreas de tecnologia e bioquímica, assim sendo, cientistas e pesquisadores começaram a trabalhar em níveis cada vez menores. Como resultado, os cientistas e os fabricantes exigiram mais e mais ambientes de trabalho rigidamente controlados. Esses ambientes de trabalho controlados passaram a ser conhecidos como "salas limpas", ambientes totalmente fechados a fim de controlar a concentração de partículas no ar. Altamente ar filtrado cai no que é geralmente um fluxo laminar para o espaço de trabalho abaixo. Todas as pessoas e os equipamentos que entram e saem do espaço são fortemente monitorados, e roupas especiais e acessórios de proteção são quase sempre necessários. Estes ambientes industriais fechados contêm equipamentos especialmente concebidos de materiais de fácil limpeza, como o aço e o plástico.

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A chave para a "sala limpa" é o número de poluentes do ar, ou partículas no ar. A esterilidade não é geralmente uma exigência, uma vez que a real preocupação quando se trabalha em escalas microscópicas é um prejuízo que pode ser feito por partículas como poeira, areia ou sal; bactérias são uma preocupação para os farmacêuticos em relação aos consumidores. A umidade pode mudar a consistência, a carga elétrica, e outras propriedades de várias substâncias. A maioria dos padrões em relação a este setor tem foco na eliminação de partículas de 0,5 mícrons ou maiores, embora algumas indústrias altamente especializadas estejam diminuindo o tamanho de partícula no nível máximo permitido. Como comparação, um cabelo humano possui cerca de 100 mícrons de diâmetro. É por isso que cada item, artigo de vestuário, fio de cabelo e pedaço de pele exposta são cuidadosamente monitorados em instalações desse tipo. Além disso, o ar que circula em uma sala limpa vindo do ambiente externo é filtrado para eliminar a poeira, e o ar no interior do recinto é constantemente reciclada através de filtros para remover quaisquer contaminantes potenciais gerados internamente.

Algumas salas limpas utilizadas por fabricantes especializados em microeletrônica, produtos farmacêuticos, ou circuitos são tão grandes como armazéns e podem manter uma alta classificação de limpeza. Os sistemas pode conter vidro, paredes de plástico, ou paredes flexíveis, feitas de material acrílico ou similar flexível. Além dos materiais usados para construir estes ambientes fechados, os materiais que estão autorizados a entrar neles são regulados com cuidado também. Materiais que são formados a partir de fibras naturais, como por exemplo, tecidos, papel e lápis, são normalmente excluídos. No entanto, existem muitas alternativas disponíveis para esses materiais. Outros materiais tradicionalmente excluídos incluem cosméticos, placas de pedra, lascas de quartzo, as partículas de alumínio, chips de silício, pó de serra e muito mais. As fontes mais comuns de contaminação são as pessoas, as ferramentas, os fluidos e o produto gerado.

Existem dois padrões distintos de classificação limpeza. O primeiro é o padrão Fed (Federal) 209, que classifica as salas limpas em quatro classes distintas: Classe 100.000 tem uma contagem de partículas inferiores a 100.000 partículas de 0,5 mícrons ou mais por pé cúbico, Classe 10000 tem uma contagem de partículas inferiores a 10 mil por metro cúbico; Classe 1000 não excede 1.000 partículas por pé cúbico, e Classe 100, a classificação mais elevada nesta norma, nunca tem mais de 100 partículas por pé cúbico. Os procedimentos de limpeza para cada uma dessas classificações variam e é grande o cuidado na seleção dos produtos utilizados nestes ambientes. O outro padrão reconhecido é o sistema padrão britânico que tem quatro classificações com base em metros cúbicos, em vez de pés, e todos os quatro níveis são ligeiramente mais rigorosos do que as normas do FED.